Die St. Martins-Kirche in Moratneustetten befindet sich im Ortskern. Sie wird als frühgotischer Bau beschrieben und soll Ende des 13. oder zu Beginn des 14. Jahrhunderts errichtet worden sein. Urkundlich konnte bisher kein genauer Entstehungszeitpunkt nachgewiesen werden.

Das Gotteshaus selbst ist ein Quadersteinbau mit einem östlich gelegenen Chorturm und anschließenden Saalbau. Dieser Saalbau zeichnet sich durch ein Halbwalmdach an der Westseite aus.

Im Jahr 1627 wurde in Moratneustetten um die St. Martins- Kirche ein Friedhof angelegt. Der Friedhof in Weihenzell reichte nicht mehr aus um die vielen Toten durch Krieg und Epidemie zu bestatten. Die Friedhofsmauer gilt als ehemalige Wehrmauer und ist mit Stützpfeilern versehen.

Die Filialkirche St. Martin in Moratneustetten mit ihrer knapp 80-Seelen-Gemeinde gehört zu der Pfarrei Weihenzell. In den Jahren 1726, 1865 und 1976 wurden an der Kirche Renovierungsmaßnahmen durchgeführt. Aus Unterlagen zu den Stiftsbauten zu Moratneustetten geht hervor, dass die Kirche früher deutlich höher aufragte. Das Fachwerk und weite Teile der Inneneinrichtung waren soweit verfallen, dass eine Instandsetzung anscheinend nicht mehr möglich war. Zudem drohte der westliche Giebel herauszustürzen. Im Zuge dessen wurde das Schiff wahrscheinlich auf seine jetzige Höhe verkleinert.

Der Turm sollte laut Riss nicht verändert werden. Jedoch weicht die auf dem Riss zu erkennende Neigung des Daches deutlich von der heutigen ab. Das Pyramidendach ist steiler geworden. Die Veränderungen fanden während der Renovierung von 1865 statt.