Der Ort Moratneustetten wird erstmalig in Oberamtsakten des St. Gumbertus Stiftes 1342 erwähnt. Dabei handelt es sich um eine Auflistung der Untertanen und welche Abgaben sie leisten mussten. Mit diesem Schriftstück wurden entweder in den Stiftsgebäuden oder vor Ort die Abgaben kontrolliert. Es wird von 5 Untertanen gesprochen.

Moratneustetten wird dabei unter dem Namen Morhartnevenstetten erwähnt. Wir beziehen uns auf diese Quelle um im Jahr 2017 675 Jahre Moratneustetten zu feiern. Es kann jedoch davon ausgegangen werden, dass der Ort etwas älter ist und vielleicht sogar in Zeiten der fränkischen Landnahme im 9. und 10. Jhd. entstanden ist. Die Ursprünge der Filialkirche werden auf das 13. oder 14 Jhd. geschätzt.

Laut dem Reichssteuerregister von 1497 sind in „Moritz Neusteten“ neun Familien beheimatet. Vornehmlich Eheleute mit Knechten und teilweise Mägden. Nur bei einer Familie wird eine Tochter erwähnt. Des Weiteren ist die Schreibweise MoretNeustett(e)n zu finden.

Moratneustetten gehörte schon immer zum Bereich des Markgrafen von Ansbach. Markgraf Georg-Friedrich schloss sich 1528 der Reformation an. Der Glaubenskrieg oder 30 Jährigen Krieg (1618-1648) zeichnete auch den Ort und dieser hatte mit den Nachwirkungen wie der Pest zu kämpfen. Infolge des Krieges kamen viele Exulanten aus dem heutigen Oberösterreich nach Franken. 1627 wurde zudem um die Filialkriche ein Friedhof angelegt. Der Weihenzeller Friedhof wurde zu klein.

Bis 1830 bildete Moratneustetten zusammen mit Neubronn, Haasgang, Wernsbach, Schönbronn, Buckhaus und Alexandermühle eine Gemeinde. Am 27. Juli 1830 wurde daraus die Gemeinde Haasgang und Wernsbach gegründet, ehe mit der Gebietsreform 1972 die Gemeinde Haasgang in die Gemeinde Weihenzell eingegliedert wurde.

Mit zahlreichen Maßnahmen wurde in den letzten Jahrzehnten die Ortschaft Moratneustetten instandgehalten und die Lebensqualität enorm verbessert.

Die Ortschaften Moratneustetten, Neubronn, Haasgang, Wernsbach, Schönbronn, Buckhaus und Alexandermühle bildeten bis 1830 eine Gemeinde. Am 27. Juli 1830 entstand daraus dann die Gemeinden  Haasgang und Wernsbach. Der Ort Moratneustetten gehörte dann bis zur Gemeindegebietsreform 1972 zur Gemeinde Haasgang - danach und bis zum heutigen Tage zur Gemeinde Weihenzell. Moratneustetten konnte sich durch Flurbereinigung und Dorferneuerung positiv weiterentwickeln.